光合作用是地球上最重要的能量转化过程。它对整个生物界和人类的生存发展以及保持自然界的生态平衡具有极其重要的意义。叶绿体是植物细胞所特有的细胞器，它是光合作用的场所。因而，叶绿体正常发育和功能维持是植物生长发育所必需；有功能的叶绿体的形成是植物进行光合作用的前提条件。本项目围绕叶绿体以及叶绿体基因表达调控所开展的系统性工作。主要贡献：(1)通过系统生物学和生物信息学的手段构建了拟南芥叶绿体蛋白相互作用网络，利用此网络，对160个未知蛋白质进行功能注释。这为研究叶绿体蛋白相关功能研究提供了有用的资源。(2)质体基因编码的聚合酶(Plastid-encoded RNA Polymerase,PEP)是叶绿体主要的RNA聚合酶。鉴定到了6个参与调控叶绿体基因表达的核因子，其中4个(AtECB1，pTAC14，pTAC7和FLN2)通过与PEP聚合酶亚基间相互作用调控PEP聚合酶活性，2个(PDM1和AtECB2)负责叶绿体转录后加工过程。这些工作深入解析了叶绿体基因表达调控这一基础生物学过程。(3)叶绿体的发育是光合作用的前提基础。鉴定到2个调控叶绿体类囊体片层发育的重要因子AtECB2和GDC1。其中，AtECB2是早期叶绿体发育所必需，其调控叶绿体片层结构的形成；而GDC1是叶绿体基粒垛叠形成所必需，其通过影响LHCII三聚体的形成来影响基粒类囊体的形成。这两个基因功能的挖掘有助于叶绿体发育的深入研究。本次申报的项目归属于生物医药技术领域，所属学科为植物学中植物生理与生化及遗传学等相关学科。    项目历时10余年，发表SCI论文14篇，其中8篇代表作被引用272次，他引234次，多项研究成果处于国际先进地位。先后获得了国家重点基础研究发展计划子课题(2009CB118504)、973预研(2003CCA01100)、国家自然科学基金项目(31100965，31570232，31470337，31370271和31100180)、上海市自然科学基金项目(10ZR1421800)等各类基金的资助。在Cell Research, Molecular Plant, Plant Journal 和Plant Physiology等在内的本学科主流期刊上发表代表作论文8篇，至今被引用272次。项目组成员曾担任国家自然科学基金委员会第12-13届学科评审组成员(2008-2011)，中国植物生理学会光合代谢专业委员会委员 (2009-2012)，上海植物生理学会副理事长，中国植物学会专业委员，国家植物基因研究中心(上海)理事会理事，上海遗传学会理事，J INTEGR PLANT BIOL编委等职务，获得“上海市曙光学者”荣誉 称号，入选2015年度国家百千万人才工程，被授予“有突出贡献中青年专家”荣誉称号，获得了2015年度上海市五一劳动奖章。